Дисциплина «Дизайн белков» является одной из продвинутых дисциплин на стыке структурной биологии, биоинформатики, хемоинформатики, химии, физики и программирования. Дисциплина является необходимой для формирования понимания принципов инженерии молекул биополимеров под нужды медицины и промышленности, а также основ работы алгоритмов, применяемых для создания и симуляционного тестирования инженерных конструкций с привлечением высокопроизводительных вычислительных средств.

Ключевая особенность программы — это абсолютная уникальность предлагаемых практических занятий, решение реальных практических проблем с помощью методов машинного обучения.

В результате обучения слушатель будет обладать компетенциями для выполнения проектов по дизайну лекарственных средств на основе белков или более сложных систем.

Учебно-методические материалы 

• Computer simulation of biomolecular systems: theoretical and experimental application (Wilfred F. van Gunsteren, Paul K. Weiner).

• Introduction to Algorithms / Cormen, Thomas H. MIT Press, 2009.

• Modelling Molecular Structures (Hinchlffe Alan).

• Molecular Modelling. Priciples and Applications (Leach R. Andrew).

• New algorithms for macromolecular simulation (B. Leimkuhler, Christophe Chipot, Ron Elber).

• Алгоритмы и структуры данных: Учебник / Белов В.В., Чистякова В.И. - М.: КУРС, НИЦ ИНФРА-М, 2016. - 240 с.

• Глик Б. Молекулярная биотехнология. Принципы и применение / Б. Глик, Дж. Пастернак. – М.: Мир, 2002. – 589 с.

• Егоров Н.С. Основы учения об антибиотиках / Н.С. Егоров. – М.: Наука, 2004. – 525 с.

• Егорова Т.А. Основы биотехнологии / Т.А. Егорова, С.М. Клунова, Е.А. Живухина. – М.: Издат. центр Академия, 2003. – 208 с.

К участию приглашаем студентов бакалавриата и магистратуры, интересующихся современными достижениями в различных областях машинного обучения в области биологии, построением новых архитектур глубоких нейронных сетей, дизайн новых функциональных структур.
Направление обучения студентов – информационные технологии, биология, физика, химия.

Для освоения содержания дополнительной профессиональной программы слушатели должны владеть следующими знаниями и компетенциями:

• базовые знания основ биологии, клеточной и молекулярной биологии;

• базовые курсы физики и химии;

• основы программирования на Python.

Форма вступительных испытаний (конкурсного отбора):

Отбор проводится на основании экспертной оценки резюме, мотивационного письма и технического собеседования.

Задания для конкурсного отбора

Резюме должно содержать:

• место учебы, уровень образования, курс обучения, средний балл;

• перечень курсов, дисциплин (модулей) по теме Программы, освоенных ранее, и результаты аттестации по данным курсам;

• описание опыта работы в научных лабораториях (стаж, функционал, полученные компетенции);

• перечень научных публикаций;

• перечень научных конференций и школ, в которых лицо, претендующее на участие в Программе, принимал(а) участие;

• уровень владения английским языком.

Мотивационное письмо должно содержать ответы на вопросы:

• почему лицу, претендующему на участие, важно стать участником именно этой программы;

• какие знания лицо, претендующее на участие в программе, планирует углубить или получить в результате участия в ней.

Критерии отбора:

Критерии экспертной оценки резюме (от 0 до 40 баллов):

• наличие освоенных курсов, дисциплин (модулей) в области молекулярной и клеточной биологии, физиологии, микробиологии, генетики, математического анализа и высшей алгебре, результаты аттестации по ним (от 0 до 10 баллов);

• наличие опыта работы в лаборатории (от 0 до 10 баллов);

• уровень предыдущих научных конференций и школ (от 0 до 10 баллов);

• качество научных публикаций (включая уровень научных журналов) (от 0 до 10 баллов).

Критерии экспертной оценки мотивационного письма, максимальный объем 3000 слов (от 0 до 40 баллов):

• аргументированность позиции (от 0 до 10 баллов);

• заинтересованность в участии в Программе (от 0 до 10 баллов);

• представление о будущей профессиональной траектории (от 0 до 10 баллов);

• объем, ясность и логичность изложения, грамотность письменной речи (от 0 до 10 баллов).

Критерии экспертной оценки технического собеседования (от 0 до 20 баллов).

• соответствие базовых знаний и навыков у лица, претендующего на участие в Программе (от 0 до 15 баллов);   

• опыт в работе со структурами белков (от 0 до 5 баллов).

Спорные вопросы решаются на уровне руководителя программы. При формировании итогового рейтинга участников, учитывается суммарный балл по всем отборочным испытаниям.

Научно-технологический университет «Сириус» обеспечивает проживание для участников программы.

Проезд/перелет, питание на программу оплачивается участником самостоятельно или за счёт Университета, в котором он обучается.
Плата за обучение на программе не взимается.

К участию в программе допускаются только граждане РФ.

На программу не допускаются студенты, принимавшие ранее участие в других дополнительных образовательных программах Университета «Сириус» в 2023-2024 году за счет средств Университета «Сириус» более 2-х раз.

Приглашенные на программу студенты, не сообщившие о невозможности прибыть на программу, не будут допущены к отбору на следующие дополнительные образовательные программы за счет средств Университета «Сириус».

Студенты, отчисленные с дополнительной профессиональной программы как не прошедшие успешно итоговую аттестацию, не будут допущены к отбору на следующие дополнительные образовательные программы за счет средств Университета «Сириус».